Иссык-Кульский государственный университет, активно участвуя в научных проектах, которые финансируются государством. В текущем 2017 году утвержден госбюджетный научно-технический проект «Экология и рациональное использование природных ресурсов высокогорных районов Иссык-Кульской области» на сумму 820,8тыс. сом. Его целью является экологическая оценка современного состояния высокогорного природного комплекса «Сары-Джаз» и рациональное использование природных ресурсов.