Ысык-Көл мамлекеттик университети Ысык-Көл облусунун Каракол шаарынын борборунда жайгашкан. Өлкөдөгү эң ири билим берүү мекемелеринин бири болгон университет, Кыргыз ССРинин Эл Комиссарлар Кеңешинин 1940-жылдын 13-июнундагы токтому менен эки жылдык мугалимдер институту катары түзүлгөн.
Институттун биринчи директору А.Шеньдрих болуп, белгилүү филолог З.Бектенов анын орун басары болуп иштеген.
1941-жылы Экинчи Дүйнөлүк Согуштун башында Фрунзедеги Педагогикалык Институту Пржевальск шаарына которулуп, мугалимдер институтуна бекитилген. Бул учурда окуу жайды Кыргызстандын эң алгачкы илимпоз-химиктеринин бири – С.Арбаев жетектеген.
1944-жылы Пржевальск шаарындагы мугалимдер институту калыбына келтирилип, ага ошол эле шаарда туулган Г.Дмитровдун ысымы ыйгарылган. 1941-жылы Улуу Ата-Мекендик согушта Беларуссия үчүн салгылашуу мезгилиндеги эрдик көрсөткөндүгү үчүн Г.Дмитровго биринчилерден болуп Советтер Союзунун Баатыры наамы тапшырылган.
СССРдин Министрлер Советинин 1953-жылдын 22-апрелиндеги чечими менен мугалимдер институтунун базасында Пржевальск мамлекеттик педагогикалык институту түзүлгөн. С.Юсупов институттун ректору болуп дайындалган. Жаңы статуска ээ болуусу менен, окуу жай педагогдорду даярдоону жогорку деңгээлге көтөрүп, Ысык-Көл жана Нарын аймактары үчүн гана эмес, бүтүндөй Кыргызстан үчүн даярдай баштаган. Ал республикадагы жогорку педагогикалык билим берүүчү алдыңкы окуу жайлардын бирине айланган.
Кыргызстан эгемендүүлүгүн алышы менен 1992-жылы 18-декабрда окуу жайыбыз университет болуп, ага таланттуу лингвист, биринчи профессор К.Тыныстановдун ысымы ыйгарылган! Университеттин окутуучулар жамааты өлкөнүн бардык тармактары үчүн квалификациялуу, керектүү кадрларды даярдай баштаган.
Университеттин сыймыгы Кыргызстанга гана эмес, чет өлкөлөргө белгилүү болгон бүтүрүүчүлөрүбүз: академиктер Ж.Жээнбаев, Б.Орузбаева, А.Карыпкулов, ошондой эле белгилүү окумуштуулар Э.Маанаев, И.Бийбосунов, А.Орусбаев, А.Токтосопиев , С.Абдуллаев, К.Дабаев, К.Абдылдаев, Н.Мааткеримов, Социалисттик Эмгектин Баатырлары К.Мамбеталиев, Ш.Шүкүрбаева, СССРдин эл мугалими Ж.Үтүров, Кыргызстандын эл мугалими Ж.Өзубекова, эмгек сиңирген мугалимдер А. Ахматов, Х.Ахметова, А.Кангелдиев, мамлекеттик жана коомдук ишмерлер Ж.Сааданбеков, Ж.Каныметов, А.Абдурехменова, Т.Мамытов, Т.Ишемкулов, А.Нарынкулов ж.б.
Ысык-Көл мамлекеттик университетинин жалпы жамааты профессорлор жана окутуучулар Х.Карасаев, З.Бектенов, К.Бейшенбаев, О.Рудковский, Ш.Токомбаев, М.Боронбаев, Э.Рыскулов, А.Майрыков, NI Университеттин өнүгүшүнө эбегейсиз салым кошкон Кузьмина, М.Жумагулов, Ж.Мамытова, Т.Орунбаев, Д.Чынгышев ж.б. окуу жайдын өсүп-өнүгүүсү үчүн кошкон салымын эч качан унутпайт.
